コロンから10km南にあるガトゥン閘門は、カリブ海からガトゥン湖まで南行きの船を30m持ち上げます。その大きさだけでも驚異的です。3組の二重閘門室が3kmにわたって伸びています。各室には、タイタニック余裕をもって。アグア クララ ビジター センター管制塔の向かい側の展望台は残念ながら現在は閉鎖されています。
ガトゥン閘門を建設するために、作業員は記録的な 182 万立方メートルのコンクリートを流し込みました。コンクリートは、円形の線路を走る貨車によって巨大な混合プラントから建設現場に運ばれました。クレーンで操作された巨大なバケツが貨車から湿ったコンクリートを運び、巨大な鋼鉄の型枠に流し込みました。機関車が型枠を所定の場所に移動しました。この長期にわたる作業は、閘門が完成するまで 4 年間、ほとんど中断することなく続きました。
船が閘門を通過すると、ペドロミゲル閘門まで37km進み、南行きの船は2組の太平洋閘門の間にある小さな水域、ミラフローレス湖まで9.3m下がって行きます。その後、船はミラフローレス閘門。