セブで最も神聖な教会には、マゼランの時代に遡る、フランドルの聖子キリスト像（サントニーニョ）が安置されています。この教会は苦難に見舞われてきました。1565年にフィリピン初の教会として設立されたこの教会は、1737年に現在のバロック様式の建物が建てられる前に、3つの建物が火災で焼失しました。2013年の地震でファサードと鐘楼が大きな被害を受けましたが、修復されました。
おそらく、この教会が過去に燃え盛ったのは、中庭で毎年、巡礼者やその他の信者の行列によって焚かれたろうそくの火のせいだろう。彼らの崇拝の対象は、祭壇の左側の礼拝堂に隠された幼子イエスの像である。この像はマゼランの時代に遡り、奇跡的であると言われている（おそらく、多くの火災を生き延びたということは奇跡的でなければならなかったのだろう）。毎年、この像はセブ最大の年中行事である「聖なる火」の目玉となる。シヌログフェスティバル。
日曜日と金曜日には、教会の外の通りは車両通行止めとなり、一日中屋外ミサが行われ、大聖堂は巡礼者、水売り、サント・ニーニョのレプリカを売る人々で賑わう。
